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引物設(shè)計的基本原則

日期:2025-01-23 06:15
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摘要: 引物設(shè)計的基本原則: 1、 引物長度:15-30 bp,常用為20 bp左右。 2、 引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。 3、 引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補序列。 4、兩個引物之間不應(yīng)存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。 5、 引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。...

引物設(shè)計的基本原則:


1、  引物長度:15-30 bp,常用為20 bp左右。


2、 引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。


3、 引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補序列。

4、兩個引物之間不應(yīng)存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。

5、 引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。

6、引物3‘端的堿基,特別是zui 末及倒數(shù)第個堿基,應(yīng)嚴格要求配對,選擇是G和C。


7、 引物的5 ′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。